В августе 2017 г. получены новые данные об экосистеме Онежского озера, отражающие ее гидрофизические особенности (температура воды), качество воды (прозрачность воды, растворенный кислород и количество сапрофитных бактерий), трофический статус (хлорофилл «а»), влияние водосборной территории (цветность воды). Представлены вертикальные профили этих параметров вдоль озера по разрезам от северо-западных прибрежных загрязненных участков с речным стоком (Петрозаводская, Кондопожская губы) до южной оконечности озера. Результаты исследований показали, что основная часть экосистемы Онежского озера по-прежнему сохраняет природные характеристики – холодноводность, высокое качество воды и олиготрофное состояние. Толщина эпилимниона достигала около 10 м, температура воды в нем не превышала 14,8‒16,7 ⁰С, термоклин в глубоководном районе озера располагался в слое 10‒20 м. Прозрачность воды в открытом плесе озера достигала 3,5‒4,0 м, ее цветность была 23‒31 град. Pt-Co шкалы, насыщение воды кислородом составляло 87‒92%, численность сапрофитного бактериопланктона не превышала n∙102 КОЕ/мл. Было отмечено значительное снижение цветности воды, обилия сапрофитных бактерий и возрастание концентраций растворенного кислорода по направлению от Петрозаводской и Кондопожской губ в сторону открытого озера. Это указывает на эффективную трансформацию аллохтонного органического вещества природного (гуминовые вещества) и антропогенного (сточные воды коммунально-промышленных центров) происхождения в заливах. Численности сапрофитных бактерий, степень насыщения воды кислородом, концентрации хлорофилла «а» в отдельных районах озера оказались немного более низкими, чем в предыдущие десятилетия. Для величины цветности воды, наоборот, отмечена тенденция к увеличению.